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limma
Microarray和RNA-Seq数据的线性模型用户指南1 介绍2 先决条件limma软件包本身可以被引用为：(2015)limma为RNA测序和微阵列研究提供差异表达分析上面的文章回顾了limma....
发布于: 2022-02-11 11:23:08 -
表观基因组学
Chip-seq应用转录因子结合（TF-DNA binding）组蛋白修饰（Histone modification）数据分析流程原始数据QC、序列比对、过滤BAM、peak calling（MACS....
发布于: 2022-01-29 13:22:59 -
10X单细胞分析流程
cellranger输入文件：[Sample Name]_S1_L00[Lane Number]_[Read Type]_001.fastq.gzs20190405WTECP3_S1_L001_R1_....
发布于: 2022-01-14 21:18:53 -
单细胞转录组数据分析流程
先决条件软件比对软件：STAR提取UMI和cell barcode：umi_tools质控fasta文件：cutadapt基因计数：featureCounts (安装subread)seuratCur....
发布于: 2022-02-21 21:36:37 -
单细胞转录组
Single-Cell Analysis VS Bulk Analysis样本很少：早期受精卵每一个细胞都有不同的基因表达稀有细胞类型：干细胞很少，不能获得其特征异质性：肿瘤的亚型，发育中不同的状态单....
发布于: 2022-01-16 18:20:08 -
Timer-肿瘤免疫研究
网站功能免疫细胞浸润的程度与基因的表达是否相关the correlation of gene expression with immune cell infiltraion levelx轴：免疫细胞的....
发布于: 2022-01-13 12:29:05 -
转录组-序列回帖-TopHat
TopHat官网传送门1 双端测序reads的方向与转录本的方向问题传统的illumina测序，无法得知哪一个reads的方向与转录本方向一致，哪一个与转录本反向互补2 junction reads需....
发布于: 2022-01-07 15:40:22 -
Gene ID的类型
CXCR4miRNA（hsa-miR-655）https://www.mirbase.org/cgi-bin/mirna_entry.pl?acc=MI0003677https://rnacentra....
发布于: 2022-01-25 18:50:43 -
GEO RNA-seq在线分析软件
参考https://www.nature.com/articles/s41598-019-43935-8https://github.com/uc-bd2k/grein....
发布于: 2021-08-20 10:14:49 -
耐药相关- GDSC
基本概念GDSC: Genomics of Drug Sensitivity in Cancer，肿瘤细胞对药物的敏感性反应IC50(the half maximal inhibitory conce....
发布于: 2021-08-18 17:30:25
生物信息学 一共收录文章81篇，
一共有9页，
每页显示10篇
