生物信息学笔记

生物信息学笔记 一共收录文章80篇, 一共有8页, 每页显示10
分子互作分析

蛋白-DNAjaspar:转录因子与DNA结合位点motif最全面的公开数据蛋白-蛋白STRINGProtein Protein InteractionRNA-RNA/DNAStarBaseTarge....

2021-04-26 15:10:27 PUBLISHED

WGBS(全基因组甲基化测序)数据分析

https://github.com/wangyang1749/yeast_data.git酵母数据介绍数据来自文章:In vivo targeting of de novo DNA methylat....

2021-04-05 19:10:53 PUBLISHED

MAplot-鉴定差异表达基因进行质量控制

MA-plot的作用是为了展示两个值几乎相等的变量(x和y)之间的关系MA-plot应用在Microarray和RNA-seq中鉴定差异基因时(基本假设,绝大多数gene不发生表达量的变化),进行质量....

2020-12-20 22:51:58 PUBLISHED

非编码miRNA、lncRNA、circRNA研究思路

非编码RNA类型经典的ncRNAribosomal RNA (rRNA)transfer RNA (tRNA)small nuclear RNA (snRNA)small nucleolar (sno....

2022-02-13 20:58:21 PUBLISHED

【哈佛大学】RNA-Seq, ChIP-Seq, and DNA methylation data analyses视频搬运目录

更新中....最后一次更新2020.12.04Section 1: RNA-seqIntroduction to RNA sequencing1.1.1 Introduction to RNA-seq....

2020-12-04 15:54:32 PUBLISHED

RNA-Seq analysis by Tohat、Cufflink、Cuffmerge、Cuffdiff、CummeRbund

TopHatA spliced read mapper for RNA-Seq. 将reads回帖到基因组参数选项-r/--mate-inner-dist <int> 插入片段的长度--....

2020-12-01 13:42:46 PUBLISHED

RNA-seq数据分析

https://github.com/wangyang1749/yeast_data.git酵母数据介绍数据来自文章:In vivo targeting of de novo DNA methylat....

2022-01-28 17:44:44 PUBLISHED

深度测序数据分析Step1(Reads mapping)

一、基本概念高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technolo....

2020-05-03 11:59:16 PUBLISHED

螳螂完整的线粒体基因组和系统发育分析

The complete mitochondrial genome of praying mantises Phyllothelys breve (Mantodea: Mantidae) and ph....

2020-05-21 22:37:36 PUBLISHED

构建多基因的系统发育树

需求:构建13个物种的13个基因的系统进化树下载需要比对的12个物种将13个物种中13个基因分别分开到单独的文件比对每一个基因拼接比对结果使用mage构建系统发育树一、下载需要比对的12个物种from....

2020-05-03 13:41:59 PUBLISHED