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de novo assembly
Reads读数是 DNA 片段。“短读长”的大小范围通常为 35 – 1,000 bp（核苷酸碱基对）。“长读长”的大小通常在 1,000 – 500,000 bp 之间。出于我们的目的，我们假设读取....
发布于: 2021-06-29 08:42:51 -
WGCNA加权基因共表达网络分析
概念WGCNA(Weighted Correlation Network Analysis)，加权基因共表达网络分析，与共表达分析不同。WGCNA是为了芯片数据开发的，能否直接用于测序数据？测序数据是....
发布于: 2022-03-09 23:03:54 -
关于生信在线分析网站的开发
oncomineGepia查看某一个癌症中的差异基因查看某一个基因的生存曲线基因的相关性分析cBioportaljava \ -jar \ -Dauthenticate=noauthses....
发布于: 2021-05-25 23:12:26 -
关于生物信息分析的可视化方案
使用plotly或者dash进行数据可视化Installation pip install plotly==4.14.3import plotly.graph_objects as gofig = g....
发布于: 2021-05-25 22:11:14 -
使用Python进行生物信息学分析
codedataset = load_dataset(source='upload')results['pca'] = analyze(dataset=dataset, tool='pca', nr_....
发布于: 2021-05-25 22:28:56 -
公共数据库测序数据获取
测序数据分析流程序列的比对和组装定量和标准化差异分析TCGA数据下载网页下载Study AbbreviationStudy Name翻译TCGA-LAMLAcute Myeloid Leukemia急....
发布于: 2022-03-01 09:34:10 -
RNA的M6A甲基化修饰
蛋白上的修饰: 翻译后修饰(Post-translational modification), 指蛋白质在翻译后的化学修饰DNA上的修饰: 表观遗传学(epigenetics), 指基于非基因序列改变....
发布于: 2021-05-04 18:21:00 -
ceRNA网络分析
表达差异获得差异的mRNAs,miRNA,lncRNA使用火山图和热图对差异分析结果进行可视化ceRNA网络lncRNA可以作为miRNA的海绵去竞争性的结合miRNA,从而调节mRNA的表达lncR....
发布于: 2021-08-09 11:36:21 -
芯片数据的下载与清洗
芯片数据下载与读取GEOqueryAnnotGPL=T 使用GPLXXX.annot.gz文件AnnotGPL=F 使用GPLXXX.soft文件gpl_1 <- getGEO("GP....
发布于: 2021-04-29 09:08:48 -
网络药理学(中药复方)
基本概念网络药理学: 是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点（Nodes）进行多靶点药物分子设计的新学科中药复方: 是指两种或两种以上的中药混合制剂,其调控网络更加复杂流程参考....
发布于: 2022-03-01 09:42:51
生物信息学 一共收录文章80篇，
一共有8页，
每页显示10篇
