在上篇文章中我们描述了miRNA的基本分析流程,本文中我们将对miRNA分析流程中每一个步骤的输出文件进行解释。软件安装在snakemake流程中可以使用conda去管理需要的软件,详细的命令使用见:....
snakemake
从网络图的邻阶矩阵(0、1矩阵,0代表指标间没有边,1代表指标间有边)中删除节点并求剩余矩阵“特征值”被用来表征网络抗毁性,该方法被用在比较不同组的微生物共现网络图的稳定性中。用法为:删除网络图中的1....
https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/118316221gffread....
构建索引用法:rsem-prepare-reference [options] reference_fasta_file(s) reference_name--gtf指基因组的注释文件,并且rsem将....
https://multiqc.info/....
Reconstructing the full-length transcriptome from short reads enabling the discovery of novel transc....
A chromosome-level draft genome of the grain aphid Sitobion miscanthiDDBJ/ENA/GenBankENAPRJNA532495G....
Molecular Signatures Database is a collection of annotated gene sets. It contains 8 major collection....
Cell Markercell_marker_data <- vroom::vroom('http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CellMarker/download/....
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