表观基因组学
最后发布时间:2022-01-29 13:22:59
浏览量:
Chip-seq
应用
转录因子结合（TF-DNA binding）
组蛋白修饰（Histone modification）
数据分析流程
原始数据QC、序列比对、过滤BAM、peak calling（MACS2）
Chip-seq数据QC（ChIPQC）
ChIP-seq下游分析：差异peak分析，motif分析，相互作用TF分析，注释和功能分析
多组学整合分析
ATAC-seq
应用
核小体位置（Nucleosome positioning）
染色质的可及性（Chromatin accessibility）
数据分析流程
原始数据QC、序列比对、过滤BAM、peak calling（MACS2）
ChIPQC质控
下游分析：差异peak分析、peak注释和功能分析、peaks区域motif分析、预测TF结合和调控网络分析
多组学整合分析
