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SCENIC-R安装及运行
SCENIC 的实现包括R版本和Python版本，本文参考SCENIC: Introduction and setup给出SCENIC R版本的安装教程及输入数据的准备先决条件支持物种SCENIC数据....
发布于: 2024-11-13 19:48:51 -
甲基化数据下游分析及可视化
全基因组甲基化水平分析通常CG甲基化存在于基因和重复序列中，在基因表达调控过程中起到非常重要的作用。非CG类型的序列（CHG和CHH）在基因中非常少见，主要存在于基因间区和含重复序列的区域，在沉默转座....
发布于: 2023-03-24 15:28:34 -
利用CellChat进行细胞间通信的推断与分析
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CellChat一种能够从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据定量推断和分析细胞间通信网络的工具。它使用网络分析和模式识别方法预测细胞的主要信号输入和输出，以及这些细胞和信号如何协调功能。
发布于: 2024-05-24 22:13:23 -
RNA-seq测序质控
测序饱和度分析冗余序列分析基因覆盖度分析....
发布于: 2023-10-30 00:11:17 -
可变剪切分析
可变剪切（differential splicing）也叫做选择性剪切（alternative splicing，AS）：指的是在 mRNA 前体到成熟 mRNA 的过程当中，不同的剪切方式使得同一个....
发布于: 2023-02-11 14:21:26
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文章及数据
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/browse/?view=series&search=RNA-seq&zsort=date&display=2....
发布于: 2024-12-03 20:41:19 -
肠道微生物健康指数GMWI2
作者Jaeyun Sung在2020年和2024年的两篇文章，分别提出了计算个体肠道微生物健康指数的方法:Gut Microbiome Wellness Index 2 enhances health....
发布于: 2024-11-21 22:47:49 -
📃The promise of explainable deep learning for omics data analysis: Adding new discovery tools to AI
📕 Journal: New Biotechnology (I.F.=4.5)🗓 Publish year: 2023🧑💻Authors: Mariangela Santorsola, Fr....
发布于: 2024-09-01 09:24:32 -
📑Deep learning methods in metagenomics: a review
📓Journal: Microbial Genomics (I.F.=4)🗓Publish year: 2024🧑💻Authors: Gaspar Roy, Edi Prifti, Euge....
发布于: 2024-09-01 09:22:32 -
📄A comprehensive survey on computational methods of non-coding RNA and disease association prediction
📗 Journal: Briefings in Bioinformatics (I.F.=6.8)🗓Publish year: 2021🧑💻Authors: Xiujuan Lei, Tho....
发布于: 2024-09-01 08:57:12
