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GWAS、MWAS、mGWAS、eQTL、miQTL
全基因组关联研究 (GWAS) 被广泛用于剖析表型变异的遗传基础1GWAS、MWAS和mGWAS基于谷子中基因型依赖性微生物效应,为精准农业提供了见解....
发布于: 2024-05-19 12:28:06 -
牙齿细胞类型图谱揭示了小鼠和人类牙齿中的干细胞和分化细胞类型
了解牙齿生长的细胞类型和机制对于牙齿的重建和工程化至关重要。因此,我们研究了生长和不生长的小鼠和人类牙齿的细胞组成。因此,我们报道了持续生长的小鼠切牙的细胞复杂性,这表明细胞动力学的连贯模型能够实现无....
发布于: 2023-06-24 11:12:43 -
宏基因组分类和组装方法及数据库综述
A review of methods and databases for metagenomic classification and assembly....
发布于: 2023-06-08 10:36:29 -
用于分类的宏基因组学工具基准
宏基因组测序正在彻底改变微生物物种的检测和表征,各种各样的软件工具可用于对这些数据进行分类。这些工具的快速发展和宏基因组数据的复杂性使得研究人员能够对其性能进行基准测试变得非常重要。在这里,我们回顾了....
发布于: 2023-06-07 10:13:29 -
Kraken:使用精确比对的超快速宏基因组序列分类
AbstractKraken是一个为宏基因组DNA序列分配taxonomic labels的超快且高度准确的程序。以前为这项任务设计的程序相对缓慢,计算成本高昂,迫使研究人员使用更快的丰度估计程序,这....
发布于: 2023-07-09 19:23:41 -
微生物组数据的扩增子和宏基因组分析实用指南
ABSTRACT高通量测序(HTS)的进展促进了微生物组研究领域的快速发展,目前正在生成大量的微生物组数据集。然而,软件工具的多样性和分析管道的复杂性使得进入该领域变得困难。在这里,我们系统地总结了微....
发布于: 2023-06-07 10:14:06 -
多模态表征映射方法来预测分子-疾病关系
随着生物医学数据的大规模增加,预测分子适应症或副作用的计算方法在提高药物发现过程的效率方面具有越来越大的前景。
发布于: 2023-04-06 09:30:45 -
non-parametric association testing for microbiome data via a zero-inflated quantile approach
文章题目:Powerful and robust non-parametric association testing for microbiome data via a zero-inflated ....
发布于: 2023-03-16 10:16:48 -
病原微生物检测
病原菌检测主要分为依赖培养和不依赖培养两种方法。前者作为病原菌检测的经典试验,主要依靠培养和生化检测,可提供满足科赫氏法则的能力、药物敏感性和生化检测等关键信息,但耗时较长,且受病原菌可培养性的限制。不依赖培养的方法包括PCR和基于高通量测序的方法。PCR或探针减少了病原菌鉴定的时间,但过度依赖引物的特异性和数量,检测结果易出现假阳性。
发布于: 2023-02-28 21:19:59 -
机器学习和深度学习在微生物组研究中的应用
我们将在生态系统中与我们息息相关的许多微生物群落统称为微生物组。虽然肉眼不可见,但是微生物组主宰或影响着宏观系统,如人类健康,植物胁迫以及生化循环
发布于: 2023-02-09 09:34:49
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