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机器学习和深度学习在微生物组研究中的应用
我们将在生态系统中与我们息息相关的许多微生物群落统称为微生物组。虽然肉眼不可见,但是微生物组主宰或影响着宏观系统,如人类健康,植物胁迫以及生化循环
发布于: 2023-02-09 09:34:49 -
综述二三代宏基因组分析的策略和工具
文章题目:Strategies and Tools in illumina & Nanopore-integrated metagenomic analysis of microbiome d....
发布于: 2023-02-03 09:12:41 -
微生物绝对丰度变化新方法(QMD)
文章题目:QMD: A new method to quantify microbial absolute abundance differences between groups发表杂志:iMeta....
发布于: 2023-01-16 21:58:23 -
基于神经网络分析肠道菌群的方法
该研究开发了一种结合神经网络和随机森林的框架,从宏基因组数据集鉴定出40个标记物种和90个标记基因,在预测中获得了更高的准确性,本研究提供了一种新的思路来识别疾病相关生物标记物并分析它们在疾病发展中所扮演的角色
发布于: 2023-01-05 09:45:11 -
深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒
该工作首次对来自人类肠道宏基因组的古菌病毒进行了深入挖掘及全面分析,揭示了人类肠道中古菌病毒组的多样性,为人类肠道古菌病毒组的研究提供了前所未有的一瞥
发布于: 2023-01-05 09:35:55 -
兼顾原核生物和病毒的宏基因组物种组成分析软件KMCP
日益增加的微生物参考基因组促进了宏基因组物种组成分析准确性的提高,同时也对宏基因组物种组成分析软件的建库效率、数据库大小、分析时间带来了严峻的挑战。
发布于: 2023-01-05 09:20:06 -
基于粪便微生物群的机器学习在多类疾病诊断中的应用
Recent studies have shown that imbalanced intestinal(肠道的) microbiota, termed “dysbiosis”(菌群失调), **contributes to**(会导致) various human diseases
发布于: 2023-01-28 09:20:32 -
利用迁移迁移学习克服区域效应实现微生物特征的跨区域疾病诊断
由于地理位置因素的影响,不同地区人群肠道微生物有非常明显的异质性, 科研人员提出一种融合迁移学习以及神经网络的框架
发布于: 2023-01-05 09:38:46
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