用于分类的宏基因组学工具基准

Benchmarking Metagenomics Tools for Taxonomic Classification

宏基因组测序正在彻底改变微生物物种的检测和表征，各种各样的软件工具可用于对这些数据进行分类。这些工具的快速发展和宏基因组数据的复杂性使得研究人员能够对其性能进行基准测试变得非常重要。在这里，我们回顾了当前宏基因组分析的方法，并使用模拟和实验数据集评估了20个宏基因组分类器的性能。我们描述了用于评估性能的关键指标，为额外分类器的比较提供了一个框架，并讨论了宏基因组数据分析的未来。