可变剪切可视化

[可变剪接类型].MATS.[JCEC|JC].txt
sda

• ID: 可变剪接ID
• GeneID: 可变剪接事件所在基因编号
• geneSymbol: 可变剪接事件所在基因名称
• chr: 可变剪接事件所在染色体
• strand: 可变剪接事件所在染色体链的方向
• exonStart_0base: 可变剪接事件跳跃外显子起始位置,以 0 开始计数
• exonEnd: 可变剪接事件跳跃外显子终止位置
• upstreamES: 可变剪接事件跳跃外显子的上游 exon 起始位置
• upstreamEE: 可变剪接事件跳跃外显子的上游 exon 终止位置
• downstreamES: 可变剪接事件跳跃外显子的下游 exon 起始位置
• downstreamEE: 可变剪接事件跳跃外显子的下游 exon 终止位置
• ID.1: 与ID一样
• IJC_SAMPLE_1: 可变剪接事件 Exon Inclusion Isoform 在差异比较组合中处理组的表达量
• SJC_SAMPLE_1: 可变剪接事件 Exon Skipping Isoform 在差异比较组合中处理组的表达量
• IJC_SAMPLE_2: 可变剪接事件 Exon Inclusion Isoform 在差异比较组合中对照组的表达量
• SJC_SAMPLE_2: 可变剪接事件 Exon Skipping Isoform 在差异比较组合中对照组的表达量
• IncFormLen: 可变剪接事件 Exon Inclusion Isoform 的有效长度
• SkipFormLen: 可变剪接事件 Exon Skipping Isoform 的有效长度
• PValue: 可变剪接事件表达差异显著性 p 值
• FDR: 可变剪接事件表达差异显著性 FDR 值
• IncLevel1: 处理组可变剪接事件 Exon Inclusion Isoform 在两个 Isoform 总表达量的比值
• IncLevel2: 对照组可变剪接事件 Exon Inclusion Isoform 在两个 Isoform 总表达量的比值
• IncLevelDifference: IncLevel1 与 IncLevel2 的差值