定量质控
最后发布时间 : 2023-02-18 19:54:51
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基因表达量水平分析
根据表达量的计算结果表格,将表达量分为不同的区间,对各样本在不同表达量区间内的基因的数目进行统计
对所有样本中共有基因数据使用Upset图展示
注:number in each set 表示每个样本鉴定到的全部基因的数目;number of each intersection表示多个样本鉴定到的基因的数目;横坐标所有点的连线表示所有样本鉴定到的共有基因的数目,其余的单点或者多个点连线,均表示相关样本中鉴定到的特有基因的数目。
Reads 在已知基因类型的分布
FPKM 密度分布
一般认为转录组的表达分析包括三个水平层面,即基因表达水平,转录本表达水平,外显子表达水平。同一个基因不同剪切形式的表达,可能引起截然不同的生物学效应。FPKM密度分布能整体地考察样品所有基因的表达量模式,一般来说中等表达的基因占绝大多数,低表达和高表达的基因占一小部分。