多序列比对

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什么是所序列比对

多序列比对（multiple alignment），对两条以上的生物序列进行全局比对。

多序列比对的主要用途

• 确认：一个未知的序列是否属于某个家族
• 建立：系统发生树，查看物种间或者序列间的关系
• 模式识别：一些特别保守的序列片段往往对应重要的功能区域，通过多序列比对，可以找到这些保守片段。
• 已知推未知：把已知有特殊功能的序列片段通过多序列比对做成模型，然后根据该模型推测未知的序列片段是否也具有该功能
• 预测蛋白质/RNA二级结构