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R语言DCA曲线
http://mdbrown.github.io/rmda/....
发布于: 2022-03-14 11:19:59 -
R分析流程
{ library("optparse") library(TCGAbiolinks) library(tidyverse) library(reshape2) opti....
发布于: 2022-11-08 10:03:21 -
R语言相关性分析
两数值型变量相关性分析相关系数大于0表示，表示有正的线性相关，小于0表示有负的线性相关，等于0表示没有线性相关。相关系数的绝对值越大，线性相关越强。可以通过相关系数检验，对样本来自总体的相关性进行检验....
发布于: 2022-03-07 15:29:44 -
Seurat中的数据对象
获取feature（gene）的count值as.data.frame(thymus.combined.filter@assays$RNA@counts[,] )[c("CD8A"....
发布于: 2022-02-28 10:59:29 -
多个单细胞数据集整合分析
Seurat integrationhttps://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction.html这些方法首先识别处于匹配生物状....
发布于: 2022-02-25 16:30:47 -
优雅的使用R debug
定位错误（Locating errors）显示调用堆栈f <- function(a) g(a)g <- function(b) h(b)h <- function(c) i(c)i....
发布于: 2022-02-20 14:33:09 -
箱线图添加显著性统计
数据准备library(ggpubr)library(rstatix)# Transform `dose` into factor variabledf <- ToothGrowthdf$dos....
发布于: 2022-02-16 14:48:23 -
R语言小RNA的靶基因预测
TargetScanhttp://www.targetscan.org/cgi-bin/targetscan/data_download.vert80.cgitargetScan <- read....
发布于: 2022-03-01 09:37:54 -
R语言临床预测模型-随机森林
随机森林简介随机森林是有监督的学习方法。在模型中，同时生成多个预测模型，并将模型的结果汇总以提升准确率。随机森林涉及对样本和变量进行抽样，从而生成大量的决策树对于样本（观察对象来说），所有决策树依次对....
发布于: 2022-03-23 16:03:37 -
limma R语言
主要文件lmFit()：线性拟合模型构建【需要两个东西：exprSet和design】 ，得到的结果再和contrast一起导入contrasts.fit()函数eBayes()：利用上一步contr....
发布于: 2022-03-03 11:06:49
Linear Models with R 、[rstudio](https://posit.cloud/content/5455615) 、[r-pkgs](https://r-pkgs.org/)、[r-graphics](https://r-graphics.org/)
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