一株禽类致病性大肠杆菌体内表达的病原体特异性和保守性基因的鉴定
大肠杆菌（Escherichia coli）是一种多样性的细菌物种，包括共生的非致病菌株如E.coli K-12，以及致病菌株，可引起不同宿主物种的多种疾病。鸟致病性大肠杆菌株X7122(O78:K80:H9)被用于鸡感染模型中，以鉴定感染组织中表达的细菌基因。通过选择性捕获转录序列和富集非E.coli K-12特异性转录本的cDNA选择方法，鉴定出了特异于病原菌的cDNA。病原菌特异性转录本对应于可能的黏附素、脂多糖核心合成、铁响应、质粒和噬菌体编码基因以及未知功能基因。通过选择性捕获转录序列鉴定出的铁胺类种子菌素系统和E.coli iro基因座的特异性缺失实验证明，这些病原菌特异性系统对X7122菌株的毒力起作用。连续的阻断以增强对病原菌特异性基因的选择并未完全消除与E.coli K-12中存在的序列相对应的转录本的存在。这些保守的E.coli基因可能在体内高度表达并对生长或毒力起贡献。总的来说，我们所采用的方法同时提供了一种鉴定体内表达的新型病原菌特异性基因和了解病原性大肠杆菌株在自然动物宿主中感染过程中的全局基因表达和生理的途径。