生物数据库

生物数据库 一共收录文章13篇, 一共有2页, 每页显示10
物种注释基因组下载

2025-03-21 15:22:48 MODIFY

从NCBI Taxonomy数据库下载分类树

进入Taxonomy数据库: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy....

2024-06-21 16:44:34 MODIFY

sra数据下载

如果下载单个样品的SRA,可以在NCBI上先找到SRA 的ID,如在NCBI上找到的Oreocharis longifolia ID为 SRR12339613,可以在服务器上输入fastq-dump ....

2024-05-03 16:58:52 PUBLISHED

NCBI微生物基因组下载(三)

https://github.com/ncbi/datasets....

2023-10-22 22:13:05 MODIFY

NCBI物种之间进化树构建

1、使用NCBI(National Center for Biotechnology Information)在线构建,选择“Taxonomy”,点击“Search”。2、点击“Common Tree....

2023-10-22 21:55:39 PUBLISHED

Pathogen Detection

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/tree/#Escherichia_coli_Shigella/PDG000000004.4085/PDS00000061....

2023-10-20 16:30:26 PUBLISHED

NCBI微生物基因组下载(二)

打开NCBI网站,输入Escherichia coli点击Assembly数据库可以看到Escherichia coli中的所有组装文件点击ASM369716v2查看组装详情可以看到ASM369716....

2023-10-22 21:36:13 PUBLISHED

微生物数据库设计

https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=p__Deinococcotahttps://mp.weixin.qq.com/s/F-88GYOxp81tKL4goKqlMQ....

2023-08-09 15:29:02 PUBLISHED

NCBI taxonomy数据库的使用

https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/accession2taxid/该目录中的文件提供了来自核苷酸、蛋白质、 WGS 或 TSA 序列记录的 accession....

2023-07-09 21:28:01 PUBLISHED

NCBI微生物基因组下载(一)

第一步 从genome数据库中下载对应信息打开NCBI,进入genome数据库从Custom resources下进入Microbes,再进入Browse microbial genomes输入需要的....

2023-10-22 21:15:40 PUBLISHED