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从NCBI Taxonomy数据库下载分类树
进入Taxonomy数据库: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy....
发布于: 2024-06-21 16:44:34 -
sra数据下载
如果下载单个样品的SRA,可以在NCBI上先找到SRA 的ID,如在NCBI上找到的Oreocharis longifolia ID为 SRR12339613,可以在服务器上输入fastq-dump ....
发布于: 2024-05-03 16:58:52 -
NCBI微生物基因组下载(三)
https://github.com/ncbi/datasets....
发布于: 2023-10-22 22:13:05 -
NCBI物种之间进化树构建
1、使用NCBI(National Center for Biotechnology Information)在线构建,选择“Taxonomy”,点击“Search”。2、点击“Common Tree....
发布于: 2023-10-22 21:55:39 -
Pathogen Detection
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/tree/#Escherichia_coli_Shigella/PDG000000004.4085/PDS00000061....
发布于: 2023-10-20 16:30:26 -
NCBI微生物基因组下载(二)
打开NCBI网站,输入Escherichia coli点击Assembly数据库可以看到Escherichia coli中的所有组装文件点击ASM369716v2查看组装详情可以看到ASM369716....
发布于: 2023-10-22 21:36:13 -
微生物数据库设计
https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=p__Deinococcotahttps://mp.weixin.qq.com/s/F-88GYOxp81tKL4goKqlMQ....
发布于: 2023-08-09 15:29:02 -
NCBI taxonomy数据库的使用
https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/accession2taxid/该目录中的文件提供了来自核苷酸、蛋白质、 WGS 或 TSA 序列记录的 accession....
发布于: 2023-07-09 21:28:01 -
NCBI微生物基因组下载(一)
第一步 从genome数据库中下载对应信息打开NCBI,进入genome数据库从Custom resources下进入Microbes,再进入Browse microbial genomes输入需要的....
发布于: 2023-10-22 21:15:40 -
NR数据库分类搭建
数据库non-redundant proteins:目前我们可以从很多数据库中获取蛋白质的序列信息,比如GenPept, Swissprot, PIR, PDB 和 NCBI RefSeq等。但是在这....
发布于: 2024-02-07 16:45:16
生物数据库 一共收录文章12篇,
一共有2页,
每页显示10篇