NCBI物种之间进化树构建

最后发布时间:2023-10-22 21:55:39 浏览量:

1、使用NCBI(National Center for Biotechnology Information)在线构建,选择“Taxonomy”,点击“Search”。

生信小木屋

2、点击“Common Tree”。

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3、输入物种名,英文学名或拉丁名均可,点击“Add”添加物种。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/taxonomy/tree/?taxon=562

Escherichia coli
bar with branchEscherichia coli 1-176-05_S1_C1
bar with branchEscherichia coli 0.1288
branchEscherichia coli 0.1304

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4、勾选“include unrank”,保存为“phylip tree”格式,下载进化树。

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(
'Escherichia coli 1-176-05_S1_C1':4,
'Escherichia coli 0.1288':4,
'Escherichia coli 0.1304':4
)'Escherichia coli':4;

5、将下载的文件上传iTOL网站(Interactive Tree Of Life)美化。

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