EVEX快速查找指定基因的调控网络

EVEX在线查询数据库（http://evexdb.org/）是一款以基因为检索对象，以PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据的文本挖掘（text mining）数据库。由于检索结果都是以被检索的基因为中心，因此条理非常清晰，大家来感受下：

以小鼠Oct4基因为例，想知道与Oct4相互作用的基因有哪些？只需在EVEX上搜索到小鼠Oct4基因。

点开之后即进入检索结果，可以看到有四类基因：

• 包括被Oct4调节的71个基因
• 能够调节Oct4的80个基因
• 与Oct4有结合的133个基因
• 以及与Oct4共同参与调节的1336个基因

以第一类为例，点开之后可以看到具体的被Oct4调节的基因，以及Confidence最高的支持这一调节关系的原文。

以Oct4调节Nanog为例，点击Show more之后可以看到所有支持这一调节关系的原文以及相应的PubMed链接。

此外，EVEX数据库还可以同时检索两个基因，这将显示这两个基因之间的调节关系。以小鼠的Oct4和Nanog为例：

点击Show interactions之后可以看到Oct4和Nanog之间的各种调节关系。可以直接查看，也可以导入Cytoscape绘制调控网络图。（后台回复 cytoscape 可获取对应文章）