SRA数据下载
最后发布时间:2022-03-28 18:03:50
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判断单双端测序文件
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layout若是标注了paired，表示是双端测序；layout若是标注了single，表示是单端测序；SRR号代表是仅有一个run的文件。
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GSM下有两个SRR的run文件，这代表2个copy，多出来的SRR的run文件可能是因为后面作者对该GSM建立的文库加测数据，每加测一次会单独保存在一个SRR的run文件里面
命令
fasterq-dump -p --split-3 --seq-defline '@$sn[_$rn]/$ri' --qual-defline '+' SRR15881871/SRR15881871.sra
参考
