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联系物种、通路、临床性状的热图
参考: https://www.nature.com/articles/s41522-021-00235-2#Fig3,https://www.nature.com/articles/s41596-0....
发布于: 2023-02-03 22:47:59 -
用三元图展示微生物种群相对丰度
图片来源三元相图 (Ternary plot) 可以展示三个变量的关系,既美观且信息更加丰富,在微生物领域常用于比较多个样品的丰度信息。安装核心R包ggtern以及一些功能辅助性R包,并载入所有R包o....
发布于: 2023-02-03 09:21:57 -
Taxonomic cladogram物种分类分支图
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发布于: 2023-02-02 17:03:19 -
circlize绘制环状热图展示细菌功能聚类分析
热图 (Heat map) 可以在微生物组研究中展示展示细菌功能聚类分析的结果,而环状热图是热图的一种表现形式。本期我们挑选2022年6月13日刊登在iMeta上的Microbial communit....
发布于: 2023-02-18 19:55:37 -
微生物组共现网络(Co-occurrence Network)绘制
图(Graph)是一种从数据中抽象出节点(Node)并用边(Edge)展示各节点之间关系的数据结构,共现网络(Co-occurrence network)是一种特殊的图。目前生态学领域用到的网络图大多....
发布于: 2022-12-04 22:42:45
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