taxonomic profiles

最后发布时间:2023-06-05 10:40:20 浏览量:

宏基因组binning是指将一个复杂的宏基因组序列数据集中的碎片序列（contig或scaffold）按照来源微生物的不同进行分类，以获得各个微生物的基因组信息。在宏基因组学研究中，由于样本中存在多个微生物群落，对不同微生物的基因组信息进行分离和提取非常重要。

宏基因组binning通常使用计算机程序自动完成，通过对contig或scaffold的物理特性、GC含量、序列相似性等进行分析，将它们归类到不同的微生物来源中。这些程序包括MetaBAT、MaxBin、CONCOCT、MyCC等。经过binning后，可以得到每个微生物的基因组组装结果，包括基因数目、基因功能注释等信息，有助于深入了解微生物的代谢功能、生态位等方面的特性。同时，这些基因组数据也可用于分析微生物群落结构、演化关系等问题的研究。