不完全是。你写的：

Linux Kernel
   ↓
GPU Driver
   ↓
GPU
   ↓
Xorg
   ↓
GNOME

方向上容易让人误解。更准确地说，应该从“谁发起请求”来看。

1. 最核心的调用链

以用户在 Firefox 中点击一个按钮为例：

鼠标
  ↓
Linux Kernel
  ↓
GPU/Input Driver
  ↓
X Server (Xorg)
  ↓
Firefox
  ↓
应用逻辑
  ↓
绘制请求
  ↓
X Server
  ↓
GPU Driver
  ↓
GPU
  ↓
显示器

但是这里还有一个重要细节：

X Server 不是简单地“接受用户指令，然后调用 GPU 驱动”。

它同时处理两类事情：

                 X Server
                /        \
               /          \
        输入事件            绘图请求
           ↑                  ↓
       Kernel              GPU/软件渲染
           ↑                  ↓
      鼠标/键盘             framebuffer

2. 用户点击鼠标时

假设你点击 Firefox：

鼠标
 ↓
USB
 ↓
Linux Kernel
 ↓
鼠标驱动
 ↓
输入子系统
 ↓
Xorg
 ↓
Firefox

Xorg 收到：

ButtonPress
x=500
y=300
button=1

然后把这个 X11 事件发送给对应的 Firefox 窗口。

所以：

输入方向：硬件 → Kernel → X Server → 应用程序

3. Firefox 要画东西时

Firefox 收到点击：

Firefox
 ↓
应用逻辑
 ↓
“我要重新绘制这个区域”

然后可能通过：

X11

向 X Server 发请求。

例如概念上：

Firefox
   │
   │ X11 request
   ▼
Xorg

Xorg 再决定如何完成这个绘制。

4. GPU 在哪里介入？

这取决于渲染方式。

现代 Linux 不一定是：

Xorg
 ↓
GPU Driver
 ↓
GPU

每次画一个按钮都直接这么走。

可能是：

Firefox
   ↓
OpenGL / Vulkan / GPU API
   ↓
Mesa / NVIDIA userspace driver
   ↓
Kernel GPU driver
   ↓
GPU

然后：

GPU
 ↓
Framebuffer
 ↓
Display controller
 ↓
HDMI/DP
 ↓
显示器

所以现代图形系统实际上复杂得多。

5. 一个更准确的物理桌面模型

你可以先记这个：

                    ┌───────────────┐
                    │ Applications  │
                    │ Firefox       │
                    │ Terminal      │
                    └───────┬───────┘
                            │
                       X11 / GL
                            │
                            ▼
                    ┌───────────────┐
                    │   Xorg        │
                    │   X Server    │
                    └───────┬───────┘
                            │
                    ┌───────┴────────┐
                    │                │
                  输入              输出
                    │                │
                    ▼                ▼
                 Kernel         GPU subsystem
                    │                │
                    ▼                ▼
              Mouse/Keyboard      GPU Driver
                                     │
                                     ▼
                                    GPU
                                     │
                                     ▼
                                  Display

6. 那 GNOME 在哪里？

这又是一个很容易搞反的地方。

GNOME 不是 X Server 的下级硬件驱动。

更准确：

             Xorg
              │
              │ X11
       ┌──────┴──────┐
       ▼             ▼
   GNOME Shell    Applications
       │
       ├── 窗口管理
       ├── Panel
       ├── Desktop UI
       └── Compositor

GNOME 是一个运行在图形系统上的用户空间程序集合。

7. 你问的“X Server 接受用户指令”要特别区分

如果你说的“用户指令”是：

鼠标/键盘

那么：

鼠标
 ↓
Kernel
 ↓
X Server
 ↓
应用

X Server 接收输入事件。

如果你说的是：

“我要画一个窗口”

那么：

应用程序
 ↓
X11 request
 ↓
X Server
 ↓
渲染系统
 ↓
GPU / CPU

X Server 接收的是应用程序的图形请求。

8. VNC 就非常有意思了

现在把 Xtigervnc 放进去。

物理桌面：

Mouse
 ↓
Kernel
 ↓
Xorg
 ↓
Firefox

Firefox
 ↓
X11
 ↓
Xorg
 ↓
GPU
 ↓
Display

VNC：

VNC Client
 ↓
VNC protocol
 ↓
Xtigervnc
 ↓
X11
 ↓
Firefox

绘制：

Firefox
 ↓
X11
 ↓
Xtigervnc
 ↓
Virtual framebuffer
 ↓
VNC protocol
 ↓
VNC Client

所以 Xtigervnc 最大的特殊之处就是：

Xorg:
    X Server
       ↓
      GPU
       ↓
    Display

Xtigervnc:
    X Server
       ↓
 Virtual framebuffer
       ↓
    VNC network

9. 这也解释了 RustDesk

如果 RustDesk 控制一个 X11 桌面：

RustDesk Client
       │
       │ 鼠标点击
       ▼
RustDesk Agent
       │
       ▼
X11 input
       │
       ▼
X Server
       │
       ▼
Firefox

然后 Firefox 更新画面：

Firefox
   ↓
X11
   ↓
X Server
   ↓
Framebuffer / GPU
   ↓
RustDesk 获取画面
   ↓
网络
   ↓
RustDesk Client

因此远程桌面实际上是一个输入闭环 + 输出闭环：

       输入
Client ───────────────→ Server
  ↑                         │
  │                         ▼
  │                    X Server
  │                         │
  │                         ▼
  │                    Application
  │                         │
  │                         ▼
  └────────────────── Desktop image
             输出

最重要的一句话

你可以把 X Server 理解成：

“图形世界的中间人/协调者”，它管理显示、输入、窗口，并为应用提供图形接口；在需要硬件加速时，图形栈再通过用户态/内核态 GPU 驱动使用 GPU。

而不是简单的：

用户
 ↓
X Server
 ↓
GPU驱动
 ↓
GPU

更准确的理解是：

                 ┌──── 输入 ────┐
                 ↓              │
鼠标/键盘 → Kernel → X Server → 应用
                            ↑      │
                            │      │ 绘制
                            │      ↓
                            └── X11 / GPU
                                   │
                              GPU Driver
                                   │
                                   ▼
                                  GPU
                                   │
                                   ▼
                                显示器

如果你下一步想真正搞懂这个调用链，最值得实验的是用一个 Rust x11rb 程序：创建 Window → 接收 KeyPress → 修改 Window → 观察 Xorg 日志/系统调用。这样你会看到“X Server 到底接受什么、应用到底调用什么、GPU 驱动到底什么时候参与”。