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nextflow

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nextflow使用的并发和并行编程的开源框架是gpars,而cromwell使用的并发和分布式处理框架是akka
Gpars:Gpars 是一个用于并行编程的 Groovy 库。它提供了一组用于并发、并行和异步编程的 API,以简化并行任务的创建和管理。Gpars 支持多线程、并行集合、数据流等概念,并提供了 Groovy DSL(领域特定语言)来描述并行任务。Gpars 可以与 Groovy 或 Java 一起使用。

Akka:Akka 是一个用于构建高并发、分布式和可容错应用的工具包。它基于 Actor 模型,通过消息传递实现并发和并行处理。Akka 提供了一个轻量级、可扩展的并发编程框架,用于编写并行任务和系统。它支持在单个计算节点或分布式环境中创建和管理 Actor,提供了容错机制、监督策略和路由等功能。

虽然 Gpars 和 Akka 都用于并发和并行编程,但它们在实现方式和语言支持方面有一些区别。Gpars 主要是为 Groovy 提供的并发库,而 Akka 则是一个独立的框架,可以与多种编程语言(如 Java、Scala 和 Kotlin)一起使用。

具体选择使用 Gpars 还是 Akka 取决于你的需求和偏好。如果你正在使用 Groovy 并希望在该语言中进行并行编程,那么 Gpars 可能是一个不错的选择。如果你需要构建分布式系统或更加通用的并发框架,那么 Akka 可能更适合。

https://www.nextflow.io/nfcamp/2019/program.html

nf-core/rnaseqtest-datasets-rnaseqnextflow on hpcbasic_training