单细胞测序绘制正常与畸形的人脑血管图谱
最后发布时间:2023-01-20 01:06:27
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文章题目：A single-cell atlas of the normal and malformed human brain vasculature
发表杂志：Science
发表时间：2022年3月4日
通讯作者：Tomasz J Nowakowski
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35084939/
脑血管系统提供营养并调节神经功能所必需的血液交换。多种细胞类型（包括内皮细胞、周细胞、平滑肌细胞和血管周围成纤维细胞）之间的协调通讯为动脉、毛细血管和静脉的功能特化提供了基础。细胞功能障碍会导致脑血管疾病，这是导致死亡和残疾的主要原因。然而目前缺乏全面的人脑脑血管细胞图谱。
本文对 181,388 个单个细胞进行 scRNA-seq，我们从人类成人脑血管系统和动静脉畸形（ AVM，Arteriovenous malformation） 中鉴定了 40 多种血管细胞、免疫细胞和邻近神经胶质细胞，发现了之前未在脑血管系统中发现的纤维肌细胞。同时还描述了脑血管源性炎症的细胞通信网络，发现血管和免疫细胞的相互作用可能导致脑出血相关的病理改变。
成人脑血管的细胞和分子特征
从5位癫痫患者的脑叶切除术中，获得正常的大脑皮层组织。显微解剖大动脉和静脉，使用已经确立的方法分离小血管（小动脉、毛细血管、小静脉）。然后使用 10X Genomics Chromium进行测序，得到74,535个细胞。对这些细胞使用graph-based Leiden进行聚类，使用差异表达的基因对聚类得到的簇进行注释，得到15个主要的细胞群。
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