多组织单细胞解构小鼠的组织和循环中NK和ILC1s细胞的复杂程序
最后发布时间:2022-07-01 11:00:35
浏览量:
Backgrond
Innate lymphoid cells (ILCs)，先天淋巴样细胞是缺乏抗原特异性受体的异质性非B非T淋巴细胞。起源于公共淋巴样祖细胞（lymphoid progenitor）。ILC位于组织中，提供对病原体侵袭的立即免疫反应，并通过抗原特异性淋巴细胞促进反应。
ILC1和NK细胞的差异尚不清楚，使用单细胞RNA测序来阐明来自组织，肿瘤和循环（circulation）的小鼠ILC1-NK细胞的基因特征。数据确定了独特的转录因子，表型标记和代谢特征，这些特征将tissue-resident的NK细胞和ILC1与循环NK细胞区分开。
这项工作中报告的数据和验证提供了一种有理方法，可以通过该方法在生理和病理状态（例如肿瘤）中区分和研究ILC1和NK细胞。
RESULTS
SCRNA-SEQ捕获NK-ILC1频谱(spectrum)中的异质性
表型分析验证了组织特异性与非组织特异性NK1.1+ NKP46+细胞的基因特异性
非组织特异性NK1.1+ NKP46+细胞显示了两层异质性
单细胞分析提供了区分NK细胞和ILC1的基础
表型分析验证了不同组织的NK细胞和ILC1分类
独特的基因签名定义了小肠，VAT和肝脏ILC1s
基因特征区分SG和子宫中的ILC1和NK细胞
肿瘤内NKP46+ NK1.1+细胞表现出突出的糖酵解特征
肿瘤重塑脾脏NK1.1+ NKP46+ metacells
实验动物
年龄在 8-12 周之间的C57BL/6雌性小鼠获自 Charles River Laboratories。对于大多数其他实验，小鼠是混合性别的，并且年龄和性别匹配。小鼠在使用时为 8-16 周龄。将小鼠饲养在特定的无病原体条件下。性别匹配的同窝小鼠被随机分配到实验组进行肿瘤研究。Tgfbr2^{fl/fl} Ncr1^{cre}由我们的实验室生成。Ldha^{f1}(B6(Cg)-Ldha^{tm1c(EUCOMM)Wtsi}/DatsJ)小鼠获自 Jackson Laboratory。Ncr1^{cre}小鼠饲养到Ldha^{fl}以产生Ldha^{fl/fl} Ncr1^{cre}。
参考
