MeSH（Medical Subject Headings）：由 NLM 提供的标准化医学主题词。
UMLS（Unified Medical Language System）：整合了多个医学词表（如 MeSH、SNOMED CT、ICD 等），为每个概念提供一个 CUI（Concept Unique Identifier）。
作用：
UMLS 数据库中：
MRCONSO.RRF：概念名称表
列有：
CUI：概念唯一 IDLAT：语言（ENG/SPA 等）SAB：词表来源（如 MSH = MeSH）STR：概念名称TTY：术语类型（PT=Preferred Term, SY=Synonym）步骤：
下载 UMLS Metathesaurus（需注册 NLM 账号）
导入 MRCONSO.RRF 表
对每个 MeSH 实体：
SELECT CUI, STR
FROM MRCONSO
WHERE STR = 'Alzheimer Disease'
AND SAB='MSH'
AND LAT='ENG';
得到对应 CUI 和同义词列表
from pymedtermino.snomedct import *
from pymedtermino.umls import *
from pymedtermino.mesh import *
# 初始化 MeSH
from pymedtermino import *
from pymedtermino.umls import *
term = MeSHConcept("D000544") # MeSH ID
cuis = term.umls_cuis() # 获取对应 UMLS CUI
print(cuis)
优点：
不用直接操作 RRF
可以直接获取同义词和跨词表映射
from quickumls import QuickUMLS
matcher = QuickUMLS('/path/to/quickumls')
matches = matcher.match("Alzheimer Disease is a neurodegenerative disorder", best_match=True)
for m in matches:
print(m[0]['cui'], m[0]['term'])
优点：
可直接从文本抽取 MeSH 实体的 CUI
支持同义词、大小写、词形变化匹配
CUI、String Search 查询 MeSH 与其他词表映射映射到 CUI 后，你可以：
获取所有同义词（从 MRCONSO 同一个 CUI 的不同 STR）
生成实体别名表
在文本匹配时覆盖更多形式
示例：
# 对 D000544 (Alzheimer Disease)
cui = 'C0002395'
synonyms = MRCONSO[MRCONSO['CUI']==cui]['STR'].tolist()
# synonyms = ['Alzheimer Disease', 'Alzheimer's Disease', 'AD', ...]
MeSH 实体 → 查询 UMLS → 获取 CUI → 获取同义词 → 构建扩展词表 → 文本匹配
优势：
统一术语，避免多种表达导致漏匹配
可直接用于实体关系抽取或共现分析
💡 小结