microRNA分类
非编码RNA类型
- 经典的ncRNA
- ribosomal RNA (rRNA)
- transfer RNA (tRNA)
- small nuclear RNA (snRNA)
- small nucleolar (snoRNA)
- telomere-associated RNA (TERC, TERRA)
- 小的ncRNA
- micRNA (miRNA)
- Piwi-associated RNAs (piRNA)
- small endogenous interfering RNAs (endo-siRNA)
- long non-coding RNA(>200nt)
- 环形RNA
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反向剪接形成环形RNA
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环形RNA的功能
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circRNA分析工具
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circRNA 数据库
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非编码RNA概述
- 非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA），指不被翻译成蛋白质的一类RNA。这些RNA大多数参与蛋白质翻译的过程，是RNA实现功能的关键分子。
mirRNA研究思路
简介
- 内源性
- 非编码
- 长度为19到25个碱基
- 单链
- 小分子RNA
体内成熟过程
miRNA的成熟过程
抑制蛋白翻译：wd检测蛋白水平降低，qPCR检测mRNA水平不变
降解mRNA：wd检测蛋白水平降低，qPCR检测mRNA水平降低
种子区域
miRNA种子序列与靶基因结合评价预测结果
主要研究思路
- 筛选miRNA：通过疾病模型筛选出有差异的miRNA分子
- 确定miRNA：miRNA的功能验证，与疾病的关系
- miRNA靶基因的预测：双荧光验证
- 靶基因功能验证：靶基因敲低、过表达，做功能实验。验证疾病、miRNA、基因通路的机制。miRNA抑制基因的某些功能，影响疾病的发生发展。
案例分析
miR-30b / 30d调节GalNAc转移酶可增强转移过程中的侵袭和免疫抑制
piRNA
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30371818/