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鉴定13个m6A相关基因的差异表达分析

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(A) 基于TCGA数据库的317个OSCC样品和32个正常对照m6A表达水平。N代表正常对照,而T代表肿瘤样品。p <0.05 *; p <0.01**; p <0.001***代表差异显著水平

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(B) 13个m6A相关基因的差异表达分析。蓝色代表正常控制,红色代表OSCC采样。

m6A相关基因相关性分析

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(C) 13个m6A相关基因之间的相关性

基于M6A的聚类(肿瘤分型)

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(A,B) 聚类分析表明,TCGA中的317个OSCC样本可以分为2组
(C) 聚类1和2之间的生存分析。
(D) 在聚类分析的基础上进行主成分分析。PCA1代表主成分分析1,而PCA2代表主成分分析2。

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(E) 聚类分析与临床特征的相关性(等级,p = 0.0352)。N代表TNM系统中的N分类,T代表TNM系统中的T分类。

预后模型的建立(风险模型构建)

所有m6A相关基因均纳入单因素和多因素cox回归研究,筛选预后相关基因

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(A,B)基于13个m6A相关基因的单变量和多变量cox回归
Hazard ratio >1 ,说明该基因是高风险基因,反之为低风险基因。高风险是指随之基因表达量的增加,患者死亡风险提高。

进行了LASSO cox回归和10倍交叉验证来确定变量

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根据lesso回归得到两个基因作为预测因子


## 肿瘤分型及检验
#### 肿瘤分型
#### 主成分分析检验分型是否成功

## 临床信息提取
#### 分型生存分析
#### 分型与临床相关性热图

## 生存模型
#### 单因素的COX分析
#### lasso回归
#### 风险生存曲线
#### ROC曲线

参考

M6A-related bioinformatics analysis reveals that HNRNPC facilitates progression of OSCC via EMT
Comprehensive Analysis of the PD-L1 and Immune Infiltrates of m6A RNA Methylation Regulators in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma